Poszukujemy doktoranta na stanowisko: pracownik inżynieryjno-techniczny w naszej grupie. Ogłoszenie znajdziesz tutaj.
Odkrywamy fizyczne mechanizmy złożonej dynamiki i organizacji cytoplazmy
Nasz zespół, należący do Katedry Modelowania Układów Złożonych, afiliowany przy Wydziale Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego, zajmuje się badaniami na styku fizyki statystycznej i biologii komórki.
Poznaj nasze zainteresowania →Główne Zainteresowania Badawcze
1. Ruchliwość białek w zatłoczonym środowisku
Zatłoczenie makrocząsteczkowe prowadzi do odchyleń od klasycznej relacji Stokesa–Einsteina, która wiąże współczynnik dyfuzji z lepkością ośrodka: $$D \neq \frac{k_\mathrm{B} T}{6\pi \eta R} .$$ Interesuje nas dlaczego efekty zatłoczenia w układach polimerowych i białkowych prowadzą do przeciwnych odchyleń.
2. Niestabilność dynamiczna cytoszkieletu
Mikrotubule wykazują dynamiczną niestabilność, przechodząc stochastycznie między stanami polimeryzacji i depolimeryzacji. Procesy te generują siły mechaniczne i umożliwiają wykonanie pracy. Interesują nas molekularne mechanizmy tych przejść oraz termodynamiczny opis takich silników polimeryzacyjnych.
3. Separacja faz ciecz-ciecz w komórkach
Cytoplazma jest układem wieloskładnikowym i wielofazowym, wypełnionym kroplami o różnorodnym składzie. Ponadto, wiele z tych równowag fazowych działa blisko stanu krytycznego, gdzie fluktuacje odgrywają istotną rolę. Interesuje nas zrozumienie tej delikatnej równowagi z wykorzystaniem klasycznej termodynamiki, symulacji komputerowych oraz teorii perkolacji.
Aktualności
Dr Tomasz Skóra, laureat konkursu Polskie Powroty NAWA, dołączył do Katedry Modelowania Układów Złożonych na Wydziale Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego. Tu zaczyna się historia naszej grupy.
Nasz Zespół
Dr Tomasz Skóra
Kierownik Grupy Badawczej
Specjalista w dziedzinie modelowania molekularnego i fizyki statystycznej. Lider projektu NAWA Polskie Powroty pt. "Od grubych ziaren do atomów i z powrotem: ścisłe wieloskalowe podejście do modelowania dyfuzji w warunkach zatłoczenia makromolekularnego".
Tomasz.Skora@fuw.edu.pl | ORCID | Google Scholar | Research Gate
Wybrane wcześniejsze publikacje kierownika
Prace te powstały, gdy dr Tomasz Skóra pracował w University of Utah (postdoc) i Instytucie Chemii Fizycznej PAN (doktorat).
- Skóra T., Wu, J., Beckett, D., Xue, W, Voth, G. A.. & Bidone, T. C. On the Curvature and Relaxation of Microtubule Plus-end Tips. Biophysical Journal 125, 406–419 (2026)
- Skóra T., Hastings, E. M., Carney, K. R., Fu, H. C., Bidone, T. C., & Sigala, P. A. Chemical propulsion of hemozoin crystal motion in malaria parasites. Proceedings of the National Academy of Sciences 122(44), e2513845122 (2025)
- Raczyłło, E., Gołowicz, D., Skóra, T., Kazimierczuk, K., & Kondrat, S. Size Sensitivity of Metabolite Diffusion in Macromolecular Crowds. Nano Letters 24, 4801–4809 (2024)
- Skóra, T., Vaghefikia, F., Fitter, J., & Kondrat, S. Macromolecular crowding: how shape and interactions affect diffusion. The Journal of Physical Chemistry B 124, 7537–7543 (2020)
Kontakt
Grupa Dynamiki i Złożoności Cytoplazmy
pok. 5.22, Wydział Fizyki, Uniwersytet Warszawski
ul. Ludwika Pasteura 5, 02-093 Warszawa
E-mail: Tomasz.Skora@fuw.edu.pl